شناسایی قطعات کروموزومی 1rs چاودار در جنس aegilops با استفاده از نشانگر مولکولی اختصاصی dna

چاودار به عنوان یک منبع ژنتیکی خارجی توسط اصلاح گرها به وفور در افزایش تنوع ژنتیکی گندم استفاده شده است، و کروموزوم 1r و بخصوص بازوی کوتاه آن 1rs به فراوانی به ژنوم گندم انتقال داده شده است. در مطالعات 1rs و انتخاب موثر از تکنیک های سیتوژنتیکی، بیوشیمیایی و نشانگرهای dna استفاده می شود. در این مطالعه وجود قطعات کروموزومی چاودار در بعضی از گونه های خانواده گندمیان با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی 1rs (ryer3/f3) بررسی شده است. برای این منظور، از چاودار، گندم نان و تعدادی از گونه های جنس aegilops، dna ژنومی استخراج و واکنش زنجیره ای پلیمراز با کمک آنزیم takara ex taqtm انجام گرفت. نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که توالی تکثیری مورد انتظار مربوط به رتروترانسپوزون های gypsy-like با طول bp1451 در dna ژنومی گونه های چاودار، گندم نان، ae. biuncialis، ae. crassa، ae. cylindrica،ae. kotschyi ، ae. speltoides و ae. taushii بر روی ژل آگارز مشاهده و صحت باندها با کمک داده های حاصل از توالی یابی تائید گردید. با رسم درخت فیلوژنتیکی، گندم نان و چاودار در یک کلاستر و همچنین ae. crassa، ae. taushii، ae. speltoides، ae. cylindrica و ae. biuncialis در کلاستر دیگری قرار گرفتند و ae. kotschyi بیشترین فاصله ژنتیکی را از گندم و چاودار از نظر توالی رتروترانسپوزونی مورد بررسی داشت. این نتایج نشان می دهد که این توالی خاص رتروترانسپوزونی در ژنوم بسیاری از گونه های خانواده گندمیان وجود دارد.